学园隐藏的秘密，在黄昏时分交错的两个世界。 ……你们没有感到疑问吗？他们从哪里来，又要回到哪里去 夜与昼的边界线总有一天——能够交汇吗。
位于深山的全寄宿制学园“天秤瑠璃学园”。 矗立着巨大时钟塔的那个地方，并非只是一所普通的学园——。 主人公·久我满琉(久我満琉)作为转校生来到这所学园后，背负起了“特殊事案调查分室”通称“特查”的职责。 与特查的同伴鹿谷忧绪(鹿ケ谷憂緒)等人一起，过着解决这所学园中发生的各种麻烦的日子。
某天，学园里出现了一位意料之外的访客。 为了寻找祖母的回忆之物，千里迢迢从异国而来的少女·阿德尔海特(アーデルハイト)。 这位不好对付的客人，被推给了特查的众人。 “是啊。就让我见识一下你们的本事吧。” 在围绕阿德尔海特寻找之物度过的日子里，至今为止理所当然流逝的所有时间开始转动。 那就是——学园隐藏的秘密，在黄昏时分交错的两个世界。
他们究竟是从哪里来的？要回到哪里去？ 而夜与昼的边界线总有一天——能够交汇吗。 面对新的谜团与秘密，主人公们的奔波再次开始！
