日美联合反恐组织“防卫省中央调查部谍报2课分室”通称CIRS，以海上油田爆炸事故为契机，其存在被公之于众。 作为隐秘组织的CIRS被重组之后，以接管极秘活动的形式，新组织SORD宣告成立。 以培养将来承担国防的人才为目的而设立的SORD，以向全国各地的学园组织借用场地的形式展开了活动。 废校后，连设施拆除费用都难以维持而被搁置的“美滨学园”被个人买下，获得了新的“特殊技能训练校”的职责。 在这样的学园里，因各种理由失去容身之所的少女们被给予的是枪与实弹。 以国防的名义，她们重复着连生命都不被顾及的危险的超法规活动。
“——我们是蒙这个世界允许才活下来的…… 但是，仅仅被允许活下去是不行的，那样就没有活着的意义。 所以，不只是被允许活下去，要靠自己的力量活下去，战斗到底，存活下来。 然后只有存活下来的孩子，才被允许活下去——” 既然是注定要被消耗殆尽的生命，选择拿起枪战斗的少女们的未来是……？
