Saika High School 创立于1624年，是西日本最古老的高中，将于2024年迎来建校400周年。图书委员Kaname Aokari不情愿地接下了制作记录学校历史网站的任务。在整理资料时，他发现了一本名为《The Bizarre Crimes of Saika High》的神秘书籍，详细记载了学校过去的悲剧。
书中透露有三名女学生被谋杀，随着Aokari继续阅读，他在“2024 - Kaname Aokari - Death”条目下发现了自己的名字。突然，一个名叫Saika、脸色苍白的男孩出现，声称：“我是来救你的。”Aokari倒下并在过去醒来，在那里他遇到了犯罪史中列出的第一名受害者Chiyoko Shirakami。Saika告诉他：“拯救她也会拯救你。”
这标志着Kaname Aokari改写命运并揭开Saika High School之谜的旅程的开始。