这是一个在迎来与史实不同结局的第二次世界大战后，经过了约半个世纪的世界里的故事。 世界大战后不久，作为战胜国中枢引领世界的某国进行了一项科学大实验，实验失败引发了一场将大半个国土化为焦土的历史性大爆炸。 该国的崩溃导致此前维持的世界军事平衡瓦解，各国为了掌握霸权而爆发了新的大战。 在那场大战中，“日本联邦共和国”、“豪厄尔王国”、“施瓦茨瓦尔德帝国”三个大国获胜并留存下来，有的国家被各自的阵营吸收，有的国家为了远离战火而保持中立，世界局势为之一变。 此后，由于长期大战的影响，三大国害怕进一步疲弊，暂时克制了争斗，世界进入了冷战状态。 然而，靠如履薄冰般脆弱的均衡维持的世界随时都有可能崩溃，各国毫不懈怠地推行征兵制度和兵器开发，推进军备扩张以备新的战争。
在那个世界里，一项研究即将取得成果。 这是一种名为“互操作系统”的通用型兵器操纵系统，是被称为代号“IOS”的革新性技术。 这种装置能够简化兵器运用所需的工序，即使没有专业知识也能像操纵手足一样自由操控所有兵器，一旦投入实用化，就能大幅减少掌握操纵的训练期以及兵器的最低运用人数，从而诞生能够驾驭陆海空所有兵器的终极万能士兵。 但是，IOS有着非适格者无法使用的限制。
本故事从隶属于“日本联邦共和国”正规军的主人公，因被认可具有IOS的适应性而加入某部队，度过执行任务的日常开始。
