位于本土南方的織戸伏島（おとふせじま）。 是一个被清澈的海洋与绿意盎然的自然所环绕的观光地，但也是一座被古老因习所束缚的离岛。 遥远往昔，从天而降的巨大火球，烧了三天三夜，烧毁了岛上的森林，还企图将岛民们也烧尽。 相传，在出海捕鱼的男人们不在的期间，守护岛屿的女人们镇住了火焰，并施下封印以免火球再次肆虐。 即使在现在，封印的过程也作为祭典举行着，两名少女被选为一对“巫女”，进行封印的仪式。
为了寻找曾是巫女的母亲的消息，一名叫高远鼎(高遠鼎)的少女，拿着转入选拔巫女的学园——崎曄女學園（さきかじょがくえん）的转学申请，跋涉来到了織戸伏島。
浮出水面的岛屿秘密—— 掌管祭事的名为松籟會（しょうらいかい）的组织。 随着祭典临近而出现的，被称为异形之物的“穢れ”的存在。
为了被选为巫女，少女们作为一对的存在，切磋琢磨，加深彼此的羁绊。 然后，当两人的灵魂共鸣之时，便会寄宿下祓除“穢れ”的奇迹之力。 少女们的恋爱与友情，以及连结灵魂的羁绊的故事——现在，开始。
