主人公仙城宗一是就读于八之木山学园的高中生。 与青梅竹马兼同班同学的长町朱音以及御前田洋一起,度过着毫无变化的每一天。 某天,宗一在学校天台吃午饭时,遇到了一位氛围不可思议的少女。 她的名字叫天原铃音。 她患上了名为“黑线病”的神秘病毒引起的疾病,是为了接受治疗而搬来的“转校生”。 宗一接受了既是铃音的主治医生也是他监护人的国见凉子的请求,开始与铃音同居。