有一天，地上的文明消失了。 从变得无法住人的大地，人们建造了地下的世界“避难所”并移居于此。 主人公与搭档菫(すみれ)，隶属于驱逐栖息在避难所中的怪物的“讨伐组”，今天也在执行任务。 有一天，在任务途中救出了一名少年。 那名少年菲夏尔(フィシャル)是从避难所的外面……在避难所中无法看到的“天空”而来的。 以与菲夏尔的相遇为契机，隐藏的黑暗逐渐显露真容……！
・主人公（初期名：伊吹(イブキ)）・ 本作的主人公，作为玩家的分身进行操作的角色 （可更改名字） 地下避难所讨伐组备受期待的新人，与搭档兼青梅竹马的菫一起与怪物战斗。
・菫・ 与主人公是青梅竹马的少女，据本人说是孽缘，一直一起学习，工作也在同一个部门。 在讨伐组中与主人公并肩作战的可靠搭档。 为了帮助主人公，自己主动卷入麻烦之中。
・菲夏尔・ 从避难所外面的“天空”掉下来的少年。 似乎遭遇了事故，受其影响记忆变得模糊。 虽然被主人公等人保护，但在避难所中知晓外界被视为禁忌，因此陷入了被追捕的境地。
・柳(ヤナギ)・ 是主人公和菫以前的老师，现在是工作上的上司。 是很好的理解者，对两人很支持。 在主人公等人面临危机时，做出了重大的决断。
・通过攻略配合剧情出现的地下城，将展开新的剧情！ ・战斗采用接触式遇敌与CTB（回合时间战斗）方式！ ・可以通过编辑技能和装备大幅改变战略！