《太平洋战记3》是一款以1回合＝3天的规模再现太平洋战争从开战到终战的战略SLG。 游戏中除了日、美、中、苏、澳之外，还有满洲、泰、法属印支、荷属印支、满洲、缅甸等15个国家登场。 游戏地图涵盖了从印度洋到夏威夷的广阔范围，根据地数量多达293处。 此外，根据推进方式的不同，在美国本土、巴拿马运河、马达加斯加、大西洋也会展开战斗。 玩家不仅要指挥日本陆海军，还要进行兵器开发、 资源开采、兵器生产、征兵、外交、占领地的治安维持等所有的战争指导。
本游戏的登场兵器以舰船1艘、飞机1架、坦克1辆、火炮1门、士兵1个分队、发动机1台、导弹1发为单位进行处理， 物资如铁矿石、原油、铝土矿、钢铁、铝、轻油、重油、弹药、水泥等也全部以1吨为单位进行再现。 登场舰船包括战列舰、航母、巡洋舰、驱逐舰、潜艇、水雷艇、海防舰、水上机母舰、飞行艇母舰、潜艇母舰、工作舰、 布雷舰、运输舰、扫雷艇、商船等共409种舰型，不仅有“神州丸”“山汐丸”等陆军舰艇， 还有“金刚代舰”“大凤改”等计划舰和架空舰大量登场。 搭载的武装种类和口径、航速、潜航深度、油耗、搭载能力、装甲厚度等也进行了精密的数值化。 此外还可以进行反潜武装强化或改装为重雷装舰、航空战列舰及航空巡洋舰等其他舰种， 1万吨以上的大型舰艇大部分都可以改装为航母。 舰船建造完全由玩家自由决定，因此像量产“岛风型”驱逐舰等史实中未曾发生的事情也能实现。 飞机方面有各国的战斗机、轰炸机、侦察机、运输机、水上飞机、飞行艇、导弹等359个机种登场， 仅零式战斗机就有12种类型可供开发。 飞机开发以三菱、中岛等制造商为单位进行，根据开发的推进方式，试作终止的“震电”或 喷气式战斗机“火龙”、梦幻的超重型轰炸机“富岳”等也能实现量产。 各飞机的航速、回旋性能、搭载炸弹、续航距离、能否夜间飞行、生产成本等都被数据化， 毫无保留地再现了各机体的特性。 此外，除飞机外，还将94种发动机进行了数据化。 根据玩家的不同，也可以将“誉”发动机作为完成度高的优秀发动机投入实用。 陆上兵力有各国的坦克、自行火炮、反坦克炮、野战炮、重炮、高射炮、防空机关炮、要塞炮、士兵等164种登场。 除了97式中型坦克、41式山炮之外，还收录了水陆两栖坦克的特2式内火艇以及仅停留在试作阶段的纳托车等。 为了再现机械化落后的日军，将军马单位化，用于牵引火炮和搬运弹药。 由于将97种车辆底盘进行了数据化，因此可以挪用拆解后的坦克底盘来生产自行火炮， 或者拆解前线的火炮，将牵引卡车转用于弹药运输等。
本游戏不仅数据缜密，游戏系统也经过打磨，满载了在缅甸和印度尼西亚建立亲日政权、 通过外交与同盟国进行和平谈判、行情对贸易的影响、工厂开工率的变更、国家间士气的差异化、 对敌阵地的破坏射击、飞机的自然损耗、向德国派遣潜艇、通过训练提高乘员熟练度、 揭发不稳分子、气温导致的地表冻结和泥泞、雷达等科学技术开发、登陆作战时的扫雷、 船团的之字形运动和反潜巡逻、向美国投放气球炸弹、使用氧气鱼雷进行远距离雷击、工兵的布雷与排雷等规则， 真实且多角度地再现了太平洋的战斗。 此外，为了架空战记爱好者，还将满洲和桦太的油田勘探、使用富岳或Ki91轰炸美国本土、使用伊400潜艇轰炸巴拿马运河等也进行了规则化。 根据游玩的推进方式，欧洲局势会发生变化，展开“如果法国没有投降？”“如果没有爆发苏德战争？”等各种状况。 此外，还搭载了可以查看登场兵器史实解说和实测值的数据库功能、 船团航线数据和物资移动数据的存档/读档功能、每个指令的自动存档、 舰船货物搭载模式记忆等众多使游玩顺利进行的功能。 进一步使用自动记录舰船竣工、沉没、战斗结果、根据地占领等的历史保存功能，可以留下玩家自己的战史。 剧本共有战役3个和短篇10个共计13个， 除了史实剧本外，还收录了追求历史假设的架空战剧本以及物资储备量丰富的入门者用剧本。 还可以选择“如果宣战赶上了珍珠港攻击？”这一选项。
本游戏除了从珍珠港攻击开始的剧本外，还收录了从1939年诺门罕事件开始、最大达到995回合的 宏大战役剧本。 剧本开始时的美英是中立国，因此可以通过贸易积蓄日本国力并扩充军备， 也可以将诺门罕事件扩大为与苏联的全面战争，或在美国参战前使中国和英国屈服，享受高自由度的发展。 此外，进驻法属印支、对日禁运措施、赫尔备忘录等也进行了规则化。
与前作一样搭载了数据编辑器。 本作中实现了编辑错误的自动检测以及编辑中的数据保存。 使用编辑器功能，除了能以“如果翔鹤和瑞鹤参加了中途岛海战会怎样？”等喜欢的设定开始游戏外， 还可以生产和运用玩家自己制作的原创兵器。
●剧本1“第一阶段作战（入门篇）” ●剧本3“大东亚战争（入门篇）” 以剧本2和剧本4为基础，设想开战时日军战略物资储备量比史实大幅充裕的状况的新手向剧本。 ●剧本2“第一阶段作战” 描写开战伊始日军势如破竹进击的剧本，再现从日美开战到南方攻略战结束的过程。 本剧本可以变更海上舰队及停泊主力舰的初期配置，因此可以将航母机动部队转用于南方攻略战， 或以长门号以下的战列舰部队迎战英国东洋舰队等，创造出各种状况。 ●剧本4“大东亚战争” 再现从日美开战到终战、最大728回合的战役剧本。 与剧本2一样可以变更主力舰的初期配置，因此可以进行符合自己战略的游玩。 是以速战速决为目标，还是为长期战做准备而攻略资源地带，玩家的战略眼光将受到考验。 ●剧本5“旭日” 在“如果日本海军夙愿的八八舰队完成了会怎样？”的设想下再现太平洋战争的架空战战役剧本。 对立的美国也通过3年计划大量建造战列舰，在太平洋上部队间将展开战列舰之间的激战。 此外，八八舰队的16艘已全部完成，也可以变更为战列舰、航空战列舰、航母。 ●剧本6“帝国国防方针” 从1939年诺门罕事件开始的本游戏最大的战役剧本。 可以将诺门罕事件扩大并直接突入与苏联的全面战争，也可以在美国参战前入侵缅甸和印度。 根据玩家的判断，历史的流向会发生改变，因此可以享受多种多样的发展。 ●剧本7“第二阶段作战” 描写MO作战（莫尔兹比港攻略）、MI作战（中途岛攻略）、AL作战（阿留申攻略）等 美澳遮断作战以及缅甸攻略战的短篇剧本，再现了珊瑚海海战和中途岛海战等。 从南方资源地带攻略完成的状态开始，因此也可以从这个剧本开始作为战役剧本享受。 ●剧本8“瓜达尔卡纳尔攻防战” 再现从美军登陆瓜达尔卡纳尔后长达半年的所罗门海战的短篇剧本。 史实中这是日方被迫承受巨大损耗而败退的战斗，究竟能否颠覆历史呢？ ●剧本9“电流作战” 再现从登陆吉尔伯特群岛开始的美军正式反攻的短篇剧本。 是按照史实将航母舰载机进驻拉包尔实施“吕号作战”，还是以航母为主力准备与美舰队的决战。 ●剧本10“马里亚纳防卫战” 美舰队涌向日本绝对国防圈的马里亚纳群岛。 另一方面，日本海军以新锐航母“大凤”为首的航母机动部队和基地航空队倾尽全力试图迎击。 再现太平洋战争天王山之战的马里亚纳海战的史实战短篇剧本。 ●剧本11“马里亚纳防卫战（架空战）” 虽然马里亚纳海战因海军乙事件和进驻迟缓等原因惨败， 但如果日军的兵力展开按计划进行，结果可能会有所不同。 本剧本是再现马里亚纳海战在日方设想状况下发生时的架空战剧本。 ●剧本12“本土决战” 如果没有原子弹投放和苏联参战，太平洋战争极有可能拖延至美军登陆日本本土。 本剧本是作为历史假设，再现决号作战及没落-冠冕作战的架空战剧本。 ●剧本13“冰山航母” 为了挽回因日军成功攻略莫尔兹比港而陷入胶着状态的战局，美国的冰山航母“哈巴库克”入侵太平洋。 航向究竟在何方？日本陆海军能否协同？又能否击沉冰山航母？ 本剧本是再现美军实际研究过的冰山航母投入实战的架空战剧本。