突然出现在世界各地的被称为“禁忌区”的魔性空间。以及从那里出现的，吞噬人类精神的怪物·噬食者。 面对任何物理攻击甚至核攻击都无效的噬食者，人类束手无策，精神被吞噬的人们接连变成了噬食者。
但是，人类不会永远无力。 能够运用被称为“玛娜”的生物能量进行攻击术·魔法的，可以打倒噬食者的战士们出现了。 人们将人类希望的战士们称为“魔女”——
培养魔女及其搭档使魔的魔女学校。 主人公·饭冢俊哉虽然入学考试不合格，但因其天生的绝伦&巨根被发现，以招待入学的形式光荣地成为了该校学生。
不会使用魔法的男性被要求的，是补给魔女所用魔法之源的“玛娜”。 男性由于其体内的玛娜被强制转换为精子，因此无法行使魔法。 作为替代，通过将精子给予魔女，即通过“性行为”可以半永久地补给玛娜。 俊哉正是被看中了这一素质。
入学经历本身就很罕见的俊哉，还将结成史无前例的“三人组”。 其对象是担任世界级偶像团体“玛娜·魔女”双中心的超人气偶像，小柳莉奈(小柳リナ)和阿丽莎＝里奈·田中(アリッサ＝里奈・田中)。 她们是被传为下一代S级魔女的超精英两人。
“玛娜补给是神圣的行为，所以不用觉得害羞” 就这样，俊哉在魔女学校的生活开始了——
