失去记忆的青年“池森彻”，为了探寻自己的过去而在横滨的街头徘徊。 他的手机里，留着曾经与自己有过交集的人物的名字和电话号码。 其中一人，是自称是他恋人的少女“米娜(ミーナ)”，彻与她一同为了寻找失去记忆的线索而四处奔走。 紧盯不放的神秘黑衣集团，以及“内阁情报调查室”的搜查官们。藏在房间里的无数枪支弹药、好几张伪装护照，更重要的是铭刻在身体上远超常人的战斗技能。 唯一可以确定的是，失去记忆前的自己绝不仅仅是个普通人……
最终，他追查到了街头巷尾议论纷纷的被称为“七宗罪杀人事件”的猎奇杀人事件，并在其中发现了自己牵涉其中的痕迹。 彻在过去写下的备忘录里，留下了疑似杀害七人的犯罪计划的文章。 “失去记忆前的自己……是连环杀人犯？” 被疑念所困，彻逐渐陷入了疑神疑鬼之中。 就在这时，一个与自己长得一模一样的神秘男子出现在他面前，事件迎来了急转直下。
与此同时—— 为了出席在横滨举办的日英和平会议而来到日本的英国女王遭到恐怖分子绑架，世界局势逐渐陷入更深的混乱之中。 事件的背后，存在着神秘犯罪组织“BABEL”，以及其成员“七贤者”。 暗流涌动的阴谋，每解开一个谜团却又陷入更深的谜团。 追寻过去到最后，彻所抵达的真相究竟是——
