故事发生在宁静的海边乡村小镇。为了躲避灾厄而失去了家园与家人的主人公尼尼,投奔母方亲戚来到了这个地方。在那里迎接他的是自称亲戚的少女木叶。对于曾将空间站视为整个世界的尼尼来说,一切都充满了新鲜的体验,然而,这个名为“秽”的威胁也正在逼近此地。