故事内容是马力欧(マリオ)等人为了拯救世界而展开冒险，这在其他作品中也屡见不鲜，虽然夹杂着搞笑元素，但有着比《纸片马力欧RPG》更加沉重阴暗的故事，除此之外，还有以“御宅族”、“自然与文明人的共存”、“死后世界”等为题材的章节登场，以及以“爱”为主题的整体故事等，展开了作为《马力欧》系列而言非常异质的故事。契合主题，作为关键道具的“纯粹之心”也不是星形，而是心形的。
由于舞台是与马力欧等人的世界不同的次元，世界观也与其他系列有着很大的不同。举例来说，作品中登场的古代之民与其说是魔法师，不如说更具有炼金术师的意味，菲亚林(フェアリン)是古代之民人工制造出的活道具，以及为了防卫纯粹之心而使用机器人（祖姆巴巴(ズンババ)）等，古代的超先进技术作为故事的背景存在着。