季节流转，顺利升入高三的自由退魔师【伊织沙耶】。 在长假即将到来、世间一片欢腾之际，她仍在为一如既往的财政困难而发愁。
正值此时，再次从情报商那里传来了“报酬丰厚的工作”的消息， 她便与搭档妖怪【祇王】一同前往委托人所在的耶多村。
不久，抵达村子的两人得知，这次的主要工作是担任途中遇到的委托人之孙、大学生【三轮健】的保镖，以及祓除最近结界开始出现破绽的村里五座古老祠堂，这让他们松了一口气。
然而这也只是暂时的，几天后出现在沙耶面前的是…… 从紫纹那里盗走重要物品的妖怪【瑠狼】。 追踪此物的无血缘关系的表哥退魔师【愁一郎】及其搭档妖怪【虚空】。 为了寻找沙耶而来的退魔师后辈【高虎】。 以及不知为何对健和沙耶表现出强烈敌意的神秘少年【奎拉】。
与此同时，沙耶负责祓除的五座古老祠堂正要发生进一步的异变。
隐约闻到的血腥味，蠢蠢欲动的物怪气息，那是……波澜悄然逼近的预感。
随着受结界保护的耶多村的历史之谜逐渐揭开，沙耶的命运之线也开始编织新的故事……
