X年2月「研究所爆炸事件」 实验中的事故导致「三波洋介」「加藤一郎」「志村幸治」「中本胜」「今野浩子」5名科学家死亡。 当时12岁失去双亲的主人公「三波洋」被隔壁的今野家收养。 少年因事件的冲击导致记忆与人格出现障碍，但他隐约记得悲剧发生前自己曾在研究所里。 毕业后三波洋与「今野好一」开办了侦探事务所。第5年，今野的父亲（刑警）在调查中为了寻找「左眼事件」的解决线索而掌握了线索，因此被埋葬在黑暗中。 今野在调查事件的过程中察觉到父亲掌握了线索，于是与三波前往港的第8仓库。 等待他们的是超乎想象的组织的阴谋。 操纵未知之力的超能力组织的目的是什么？而三波的秘密又是什么？
「左眼事件」 所有离奇事件的尸体唯一的共同点，是只有被害者的左眼球被挖出。被害者的人数接近60人。犯人的目的完全不明，但并非无差别袭击，而是针对特定的人物。
