2020年，日本。 住在东京湾环绕的“环形区域”内贫民区的主人公・藤枝涅莉(藤枝ネリ)。
虽然过着朴素而平稳的日子， 但某天突然，唯一的家人父亲失踪了。
“去櫂宫学园吧” 留下了一封谜之信。
私立櫂宫学园。 只招收属于特权阶级的良家子女，以培养肩负未来日本的精英为目的而创设的全日制寄宿名校。
遵从涅莉父亲的留言，转入了名流云集的宫学园。 然而那里虽然极度奢华，却是基于绝对阶级制度，被“身份歧视”支配的学园。
在阶级制度的顶点统治学生，拥有所有权力的“女王”， 在所有方面都占据优势，属于被选中的精英们的特权阶级“盛开的蔷薇”， 最多学生所属的平民阶级“无名蜜蜂”， 明明是同样的学生，却被当作仆人一样虐待驱使的奴隶阶级“被抛弃的石子”。
以及，由抵抗绝对制度的学生组织的反体制集团“抵抗组织”。
在难以想象的差距社会中涅莉相遇的『恋爱』， 逐渐浮出水面的学园的『真实』究竟——！？
