季节流转，顺利升入高三的自由退魔师伊织沙耶(伊織 沙耶)。 在长假临近、世人欢腾之际，她依然为老样子的财政困难而苦恼。
正值此时，情报贩子再次带来了“报酬丰厚的工作”的消息， 她与搭档的妖祇王(祇王)一同前往委托人所在的耶多村。
不久，抵达村子的两人，从途中遇到的 委托人的孙子、大学生三轮健(三轮健)的保镖， 以及对最近结界开始出现破绽的村里五座古老祠堂进行祓除，得知这些便是本次的主要工作后松了一口气。
然而这只是暂时的，几天后出现在沙耶面前的是…… 从紫纹那里盗走重要物品的妖瑠狼(瑠狼)。 追踪他的没有血缘关系的堂兄退魔师伊织愁一郎(愁一郎)及其搭档的妖虚空(虚空)。 为了寻找沙耶而来的退魔师后辈利光高虎(高虎)。 以及不知为何对健和沙耶表现出强烈敌意的神秘氛围少年奎拉(クイラ)。
那时，在沙耶受托祓除的五座古老祠堂中，正要发生进一步的异变。
隐约闻到的血腥味，开始蠢蠢欲动的物怪气息，那是……静静逼近的波澜预感。
随着受结界保护的耶多村的历史之谜逐渐明朗，沙耶的命运之线也开始编织新的故事……
