住在被海与山环绕的乡下小镇的学生——晃(あきら)，在去观测本世纪最初也是最后的大流星雨时，被某人贯穿腹部而死——在逐渐消逝的意识中他所看到的，是令人难以相信存在于地球上的、黑色的异形生命体——“扎伊弗斯”。就在它要对动弹不得的他给予致命一击时，一名美少女仿佛为了保护晃一般现身，与扎伊弗斯展开了势均力敌的死斗。
她虽然外表是人类，但真相是那家伙的天敌、由白色生命体诞生的“梅塔莫斯”。以此为契机，晃被卷入了异种间的战争。那一刻正是人类首次与地球外生命体进行智性接触的瞬间，也是决定了这将成为晃人生中绝对无法忘怀的夏天的瞬间……。
